Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cited4Q9WUL8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cited4Q9WUL8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cited4Q9WUL8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cited4Q9WUL8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms