Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tnfsf13bQ9WU72 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnfsf13bQ9WU72 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms