Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lemd3Q9WU40 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lemd3Q9WU40 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Lemd3Q9WU40 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Lemd3Q9WU40 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Lemd3Q9WU40 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Lemd3Q9WU40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Lemd3Q9WU40 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms