Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdh13Q9WTR5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdh13Q9WTR5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdh13Q9WTR5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdh13Q9WTR5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms