Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Abcc6Q9R1S7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Abcc6Q9R1S7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Abcc6Q9R1S7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Abcc6Q9R1S7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Abcc6Q9R1S7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Abcc6Q9R1S7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms