Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Psma4Q9R1P0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Psma4Q9R1P0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psma4Q9R1P0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms