Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmed2Q9R0Q3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmed2Q9R0Q3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmed2Q9R0Q3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmed2Q9R0Q3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms