Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M4

Podxl, Podocalyxin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodxlQ9R0M4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PodxlQ9R0M4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PodxlQ9R0M4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PodxlQ9R0M4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms