Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Vav3Q9R0C8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vav3Q9R0C8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vav3Q9R0C8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vav3Q9R0C8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms