Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col4a4Q9QZR9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a4Q9QZR9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a4Q9QZR9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a4Q9QZR9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col4a4Q9QZR9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms