Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rad18Q9QXK2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rad18Q9QXK2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rad18Q9QXK2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rad18Q9QXK2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms