Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Limd1Q9QXD8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Limd1Q9QXD8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Limd1Q9QXD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Limd1Q9QXD8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limd1Q9QXD8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms