Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trpc5Q9QX29 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Trpc5Q9QX29 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trpc5Q9QX29 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trpc5Q9QX29 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trpc5Q9QX29 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms