Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN5

Prl3c1, Prolactin-3C1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3c1Q9QUN5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prl3c1Q9QUN5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prl3c1Q9QUN5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prl3c1Q9QUN5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prl3c1Q9QUN5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms