Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trappc2lQ9JME7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc2lQ9JME7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc2lQ9JME7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trappc2lQ9JME7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms