Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cabp1Q9JLK7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cabp1Q9JLK7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cabp1Q9JLK7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cabp1Q9JLK7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cabp1Q9JLK7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms