Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
AtrQ9JKK8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrQ9JKK8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrQ9JKK8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms