Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK91

Mlh1, DNA mismatch repair protein Mlh1, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlh1Q9JK91 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mlh1Q9JK91 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mlh1Q9JK91 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mlh1Q9JK91 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mlh1Q9JK91 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms