Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK23

Psmg1, Proteasome assembly chaperone 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg1Q9JK23 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmg1Q9JK23 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmg1Q9JK23 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmg1Q9JK23 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmg1Q9JK23 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms