Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga3Q9JJZ8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cnga3Q9JJZ8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cnga3Q9JJZ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cnga3Q9JJZ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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