Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bgrlQ9JJU8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sh3bgrlQ9JJU8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sh3bgrlQ9JJU8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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