Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Riox1Q9JJF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Riox1Q9JJF3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Riox1Q9JJF3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms