Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RprmQ9JJ72 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RprmQ9JJ72 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RprmQ9JJ72 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RprmQ9JJ72 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RprmQ9JJ72 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms