Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc12a4Q9JIS8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc12a4Q9JIS8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc12a4Q9JIS8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms