Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn19Q9ET38 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cldn19Q9ET38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Cldn19Q9ET38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn19Q9ET38 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn19Q9ET38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms