Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ms4a4bQ9ES61 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms