Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tfip11Q9ERA6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tfip11Q9ERA6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tfip11Q9ERA6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tfip11Q9ERA6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms