Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Clstn2Q9ER65 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Clstn2Q9ER65 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Clstn2Q9ER65 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Clstn2Q9ER65 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Clstn2Q9ER65 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms