Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER05

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtrlQ9ER05 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CtrlQ9ER05 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CtrlQ9ER05 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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CtrlQ9ER05 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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CtrlQ9ER05 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CtrlQ9ER05 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtrlQ9ER05 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtrlQ9ER05 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtrlQ9ER05 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtrlQ9ER05 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtrlQ9ER05 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CtrlQ9ER05 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CtrlQ9ER05 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms