Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SgshQ9EQ08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SgshQ9EQ08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgshQ9EQ08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SgshQ9EQ08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms