Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cbx6Q9DBY5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cbx6Q9DBY5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cbx6Q9DBY5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx6Q9DBY5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx6Q9DBY5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms