Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Foxp4Q9DBY0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Foxp4Q9DBY0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Foxp4Q9DBY0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Foxp4Q9DBY0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Foxp4Q9DBY0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms