Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SrpraQ9DBG7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrpraQ9DBG7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrpraQ9DBG7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrpraQ9DBG7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrpraQ9DBG7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SrpraQ9DBG7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SrpraQ9DBG7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SrpraQ9DBG7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SrpraQ9DBG7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms