Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Med29Q9DB91 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Med29Q9DB91 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Med29Q9DB91 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms