Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pfn3Q9DAD6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pfn3Q9DAD6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pfn3Q9DAD6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfn3Q9DAD6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfn3Q9DAD6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfn3Q9DAD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfn3Q9DAD6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pfn3Q9DAD6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pfn3Q9DAD6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.7 ms