Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Actrt1Q9D9J3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actrt1Q9D9J3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actrt1Q9D9J3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actrt1Q9D9J3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms