Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmd12Q9D8W5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmd12Q9D8W5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psmd12Q9D8W5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmd12Q9D8W5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms