Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8L0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8L0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D8L0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8L0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D8L0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8L0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9D8L0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9D8L0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8L0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8L0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9D8L0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms