Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rpl4Q9D8E6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rpl4Q9D8E6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rpl4Q9D8E6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rpl4Q9D8E6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms