Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kctd4Q9D7X1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kctd4Q9D7X1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Kctd4Q9D7X1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms