Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D7E4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9D7E4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D7E4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D7E4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D7E4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D7E4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D7E4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D7E4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D7E4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9D7E4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms