Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf225Q9D7D1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf225Q9D7D1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf225Q9D7D1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf225Q9D7D1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms