Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Necab3Q9D6J4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab3Q9D6J4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab3Q9D6J4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms