Protein–RNA interactions for Protein: Q9D593

Atp6v1e2, V-type proton ATPase subunit E 2, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1e2Q9D593 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp6v1e2Q9D593 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp6v1e2Q9D593 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp6v1e2Q9D593 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms