Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zc2hc1bQ9D534 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zc2hc1bQ9D534 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms