Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam227bQ9D518 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam227bQ9D518 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam227bQ9D518 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fam227bQ9D518 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam227bQ9D518 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam227bQ9D518 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam227bQ9D518 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam227bQ9D518 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam227bQ9D518 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam227bQ9D518 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam227bQ9D518 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms