Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox2aQ9D4Y3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhox2aQ9D4Y3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rhox2aQ9D4Y3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rhox2aQ9D4Y3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox2aQ9D4Y3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox2aQ9D4Y3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox2aQ9D4Y3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rhox2aQ9D4Y3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms