Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4930564D02RikQ9D4S4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930564D02RikQ9D4S4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930564D02RikQ9D4S4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930564D02RikQ9D4S4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms