Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phf6Q9D4J7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf6Q9D4J7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf6Q9D4J7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Phf6Q9D4J7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.9 ms