Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lonrf3Q9D4H7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lonrf3Q9D4H7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lonrf3Q9D4H7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms